W 1988 opiekę nad zespołem objął Andrzej Affeltowicz. Od 1990 nosi nazwę Polskiej Młodzieżowej Orkiestry Symfonicznej. Uczestnictwo orkiestry w festiwalach stało się źródłem inspiracji do pracy, a nawiązane w ten sposób kontakty umożliwiły zaproszenia do Danii, Szkocji, Niemiec, Monachium, Austrii.
Zespół często koncertuje dla polskiej publiczności. Występował w Filharmonii w Krakowie, Poznaniu, Szczecinie, w salach koncertowych Narodowej Orkiestry Symfonicznej Polskiego Radia, w Studio Polskiego Radia S1, Akademii Muzycznej w Warszawie. Wielkim wyróżnieniem są występy w Filharmonii Narodowej (od 1990).
Orkiestra wielokrotnie akompaniowała solistom podczas Śląskiego Konkursu Pianistycznego w Zabrzu. Od 2005 towarzyszy również laureatom Ogólnopolskiego Festiwalu Fagotowo-Obojowego. Tradycją są koncerty dyplomantów szkoły z towarzyszeniem zespołu.
Od 2015 PMOS pracowała pod dyrekcją Macieja Tomasiewicza. W 2015 wzięła udział w Ogólnopolskim Konkursie Orkiestr Szkół Muzycznych II st. i wystąpiła podczas finału wydarzenia w Studio Koncertowym Polskiego Radia. W 2016 wystąpiła na Szalonych Dniach Muzyki, a kolejnym sukcesem okazał się występ w czasie gali jubileuszu 70-lecia działalności szkoły.
Od października 2019 PMOS pracowała pod kierunkiem Marty Zielińskiej. Zespół towarzyszył solistom w czasie koncertów, brał udział w wydarzeniach dla środowiska, koncertował w Operze Śląskiej. Sukcesem było wykonanie utworu Gloria Karla Jenkinsa.
We wrześniu 2022 opiekę nad orkiestrą przejął Filip Huget. Zespół realizuje w ostatnim czasie liczne projekty: prezentację repertuaru związanego z Narodowym Świętem Niepodległości, popularyzację muzyki współczesnej czy towarzyszenie uczestnikom Śląskiego Konkursu Pianistycznego w Zabrzu.